选择副本忍者时，应优先考虑具备高伤害、范围攻击和稳定控制能力的角色，以高效应对群体敌人和首领挑战。宇智波鼬是公认的副本首选，其天照技能提供远程压制和持久控制效果，配合大招的高浮空伤害能快速清理密集敌人；奇拉比作为前排突进型忍者，防御能力出色，能有效承受伤害并为队伍创造输出空间；小志乃则通过持续性虫子攻击扰乱敌人，在团队中贡献稳定伤害。这些忍者不仅强度高，获取和操作难度也相对适中，适合多种副本环境。。
新手玩家在前期副本中应专注于获取和培养易于上手的过渡型忍者，确保快速适应游戏节奏并节省资源。春野樱技能简单直接，普攻节奏稳定且带抓取效果，生存和输出均衡；宇智波佐助兼顾近战与远攻，连招流畅且伤害可观；奈良鹿丸依靠影子操控术和爆式翔刃安全风筝敌人，适合操作不熟练的玩家；漩涡鸣人作为初始忍者，技能爆发高且刷图效率良好。通过连续登录或精英副本即可免费获得这些忍者，避免在早期浪费金币追求稀有角色。。
A级忍者是副本挑战的中坚力量，选择技能范围广、连招稳定的角色能显著提升刷图效率。猿飞阿斯玛的双刀流聚怪接火遁组合擅长应对群体敌人；迈特凯通过生存挑战优先兑换，升星后战力提升明显；蝎和鬼鲛作为实用型A忍，获取难度低且伤害可靠。培养时应优先升级技能范围大的忍者，并合理分配资源，避免过早集中在单一角色上，同时通过活动和副本收集碎片以加速忍者成长。。
副本战斗策略强调技能选择与时机把控，输出型技能应优先高伤害AOE如月读或麒麟，快速解决多个敌人；辅助技能如治疗之术需在队友血量危险时释放，护盾类技能则应提前开启以抵挡首领爆发伤害；控制技能如影子操控术或虫玉能限制敌人行动，为队伍争取输出时间。合理分配技能冷却时间，避免在高压战斗中缺失关键能力，同时根据地图障碍或敌人分布调整位移技能使用，例如瞬身或跳跃角色可灵活规避地形限制。。
团队阵容搭配和忍者养成是副本成功的关键，队伍中应包含输出型、防御型和辅助型角色以实现攻守平衡。输出型忍者负责快速清怪，防御型能扛住高额伤害，辅助型则提供治疗和控制支持；忍者品质和星级直接影响战斗表现，优先培养通用性强的角色并通过升级、技能提升和装备精炼增强战力。饰品和忍具应侧重攻击与暴击属性，同时注意副本中道具如治疗药水的及时使用，以应对突发情况并保障队伍续航。。
